Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL15Q96M94 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms