Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms