Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms