Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C18orf8Q96DM3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms