Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VANGL1Q8TAA9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms