Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOT1Q8IXI2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms