Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC22A9Q8IVM8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms