Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms