Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms