Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RFPL4BQ6ZWI9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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