Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms