Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms