Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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