Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms