Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM20Q15388 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms