Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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RABEP1Q15276 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABEP1Q15276 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABEP1Q15276 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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