Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms