Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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