Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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