Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF2H3Q13889 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF2H3Q13889 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF2H3Q13889 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms