Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LSAMPQ13449 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LSAMPQ13449 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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