Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SCGB2A2Q13296 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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