Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENBP1Q13228 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms