Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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