Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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