Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms