Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBBP4Q09028 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms