Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms