Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXM1Q08050 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms