Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBQ06643 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms