Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABPB1Q06547 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPB1Q06547 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms