Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms