Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDR2Q01850 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDR2Q01850 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms