Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms