Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms