Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKL1Q00532 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms