Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FAM3AP98173 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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