Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM193AP78312 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms