Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P63121 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms