Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms