Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA9P57773 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms