Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms