Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX2P50458 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms