Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms