Protein–RNA interactions for Protein: P48594

SERPINB4, Serpin B4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB4P48594 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERPINB4P48594 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms