Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB2P47870 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms