Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms