Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms