Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms