Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHC1P29353 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHC1P29353 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHC1P29353 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms